Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ09

UBAP1, Ubiquitin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP1Q9NZ09 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
UBAP1Q9NZ09 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
UBAP1Q9NZ09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBAP1Q9NZ09 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBAP1Q9NZ09 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBAP1Q9NZ09 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UBAP1Q9NZ09 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
UBAP1Q9NZ09 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms