Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DDX43Q9NXZ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DDX43Q9NXZ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
DDX43Q9NXZ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
DDX43Q9NXZ2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
DDX43Q9NXZ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
DDX43Q9NXZ2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DDX43Q9NXZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms