Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWA0

MED9, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED9Q9NWA0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MED9Q9NWA0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MED9Q9NWA0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MED9Q9NWA0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
MED9Q9NWA0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MED9Q9NWA0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MED9Q9NWA0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms