Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TBCCD1Q9NVR7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TBCCD1Q9NVR7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBCCD1Q9NVR7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBCCD1Q9NVR7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TBCCD1Q9NVR7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TBCCD1Q9NVR7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms