Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP1

DDX18, ATP-dependent RNA helicase DDX18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX18Q9NVP1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
DDX18Q9NVP1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DDX18Q9NVP1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DDX18Q9NVP1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DDX18Q9NVP1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX18Q9NVP1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DDX18Q9NVP1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDX18Q9NVP1 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms