Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR1

CYTL1, Cytokine-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTL1Q9NRR1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTL1Q9NRR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CYTL1Q9NRR1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTL1Q9NRR1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CYTL1Q9NRR1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CYTL1Q9NRR1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CYTL1Q9NRR1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CYTL1Q9NRR1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CYTL1Q9NRR1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CYTL1Q9NRR1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CYTL1Q9NRR1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CYTL1Q9NRR1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms