Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BATF3Q9NR55 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BATF3Q9NR55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BATF3Q9NR55 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BATF3Q9NR55 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BATF3Q9NR55 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BATF3Q9NR55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BATF3Q9NR55 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms