Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ55

PPAN, Suppressor of SWI4 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPANQ9NQ55 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPANQ9NQ55 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPANQ9NQ55 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPANQ9NQ55 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPANQ9NQ55 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPANQ9NQ55 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPANQ9NQ55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPANQ9NQ55 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPANQ9NQ55 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPANQ9NQ55 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPANQ9NQ55 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPANQ9NQ55 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPANQ9NQ55 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPANQ9NQ55 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPANQ9NQ55 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PPANQ9NQ55 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPANQ9NQ55 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PPANQ9NQ55 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PPANQ9NQ55 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PPANQ9NQ55 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms