Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE2

NGRN, Neugrin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGRNQ9NPE2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NGRNQ9NPE2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NGRNQ9NPE2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NGRNQ9NPE2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NGRNQ9NPE2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NGRNQ9NPE2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
NGRNQ9NPE2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NGRNQ9NPE2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms