Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP80

PNPLA8, Calcium-independent phospholipase A2-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA8Q9NP80 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PNPLA8Q9NP80 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PNPLA8Q9NP80 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PNPLA8Q9NP80 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PNPLA8Q9NP80 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNPLA8Q9NP80 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PNPLA8Q9NP80 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PNPLA8Q9NP80 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PNPLA8Q9NP80 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PNPLA8Q9NP80 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PNPLA8Q9NP80 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PNPLA8Q9NP80 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PNPLA8Q9NP80 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PNPLA8Q9NP80 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms