Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PLXNA4Q9HCM2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PLXNA4Q9HCM2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PLXNA4Q9HCM2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PLXNA4Q9HCM2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PLXNA4Q9HCM2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PLXNA4Q9HCM2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PLXNA4Q9HCM2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms