Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC6

HES4, Transcription factor HES-4, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES4Q9HCC6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HES4Q9HCC6 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HES4Q9HCC6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HES4Q9HCC6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HES4Q9HCC6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HES4Q9HCC6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HES4Q9HCC6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms