Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9A5

CNOT10, CCR4-NOT transcription complex subunit 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT10Q9H9A5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNOT10Q9H9A5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNOT10Q9H9A5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CNOT10Q9H9A5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNOT10Q9H9A5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNOT10Q9H9A5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNOT10Q9H9A5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CNOT10Q9H9A5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT10Q9H9A5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CNOT10Q9H9A5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms