Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W2

LINC00472, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00472, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00472Q9H8W2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00472Q9H8W2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC00472Q9H8W2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LINC00472Q9H8W2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00472Q9H8W2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LINC00472Q9H8W2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms