Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7J1

PPP1R3E, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3E, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3EQ9H7J1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPP1R3EQ9H7J1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R3EQ9H7J1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPP1R3EQ9H7J1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPP1R3EQ9H7J1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R3EQ9H7J1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R3EQ9H7J1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R3EQ9H7J1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms