Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXO5Q9H790 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXO5Q9H790 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXO5Q9H790 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXO5Q9H790 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXO5Q9H790 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXO5Q9H790 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms