Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V8

CDCP1, CUB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP1Q9H5V8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDCP1Q9H5V8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDCP1Q9H5V8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDCP1Q9H5V8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDCP1Q9H5V8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDCP1Q9H5V8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDCP1Q9H5V8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.7 ms