Protein–RNA interactions for Protein: Q9H161

ALX4, Homeobox protein aristaless-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX4Q9H161 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ALX4Q9H161 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ALX4Q9H161 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ALX4Q9H161 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX4Q9H161 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALX4Q9H161 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALX4Q9H161 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms