Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W9

C11orf54, Ester hydrolase C11orf54, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf54Q9H0W9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C11orf54Q9H0W9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
C11orf54Q9H0W9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C11orf54Q9H0W9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C11orf54Q9H0W9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
C11orf54Q9H0W9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C11orf54Q9H0W9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms