Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLIRPQ9GZT3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLIRPQ9GZT3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLIRPQ9GZT3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLIRPQ9GZT3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLIRPQ9GZT3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLIRPQ9GZT3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLIRPQ9GZT3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLIRPQ9GZT3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLIRPQ9GZT3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLIRPQ9GZT3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLIRPQ9GZT3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLIRPQ9GZT3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLIRPQ9GZT3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms