Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SHCBP1LQ9BZQ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SHCBP1LQ9BZQ2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SHCBP1LQ9BZQ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SHCBP1LQ9BZQ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SHCBP1LQ9BZQ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SHCBP1LQ9BZQ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SHCBP1LQ9BZQ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms