Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CPEB1Q9BZB8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CPEB1Q9BZB8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CPEB1Q9BZB8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CPEB1Q9BZB8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CPEB1Q9BZB8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CPEB1Q9BZB8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CPEB1Q9BZB8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms