Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUE0

MED18, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 18, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED18Q9BUE0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MED18Q9BUE0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED18Q9BUE0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED18Q9BUE0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED18Q9BUE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED18Q9BUE0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED18Q9BUE0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MED18Q9BUE0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 193 ms