Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
H2AFJQ9BTM1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
H2AFJQ9BTM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
H2AFJQ9BTM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
H2AFJQ9BTM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
H2AFJQ9BTM1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
H2AFJQ9BTM1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
H2AFJQ9BTM1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms