Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms