Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CHCHD5Q9BSY4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD5Q9BSY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CHCHD5Q9BSY4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CHCHD5Q9BSY4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CHCHD5Q9BSY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.4 ms