Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms