Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
PRADC1Q9BSG0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PRADC1Q9BSG0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRADC1Q9BSG0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PRADC1Q9BSG0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
PRADC1Q9BSG0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms