Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00467Q9BRT7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00467Q9BRT7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
LINC00467Q9BRT7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LINC00467Q9BRT7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
LINC00467Q9BRT7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms