Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS7

HEPH, Hephaestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HEPHQ9BQS7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HEPHQ9BQS7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HEPHQ9BQS7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HEPHQ9BQS7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HEPHQ9BQS7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HEPHQ9BQS7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HEPHQ9BQS7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
HEPHQ9BQS7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.77■■□□□ 1.88
HEPHQ9BQS7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
HEPHQ9BQS7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms