Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE4

SELENOS, Selenoprotein S, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOSQ9BQE4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SELENOSQ9BQE4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SELENOSQ9BQE4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SELENOSQ9BQE4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SELENOSQ9BQE4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SELENOSQ9BQE4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SELENOSQ9BQE4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SELENOSQ9BQE4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SELENOSQ9BQE4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SELENOSQ9BQE4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SELENOSQ9BQE4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms