Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ83

SLX1A, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX1AQ9BQ83 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLX1AQ9BQ83 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLX1AQ9BQ83 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLX1AQ9BQ83 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SLX1AQ9BQ83 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SLX1AQ9BQ83 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLX1AQ9BQ83 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLX1AQ9BQ83 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms