Protein–RNA interactions for Protein: Q99805

TM9SF2, Transmembrane 9 superfamily member 2, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM9SF2Q99805 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TM9SF2Q99805 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TM9SF2Q99805 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TM9SF2Q99805 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TM9SF2Q99805 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TM9SF2Q99805 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TM9SF2Q99805 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TM9SF2Q99805 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms