Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
LITAFQ99732 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LITAFQ99732 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LITAFQ99732 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LITAFQ99732 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LITAFQ99732 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LITAFQ99732 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms