Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SIGMAR1Q99720 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SIGMAR1Q99720 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SIGMAR1Q99720 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SIGMAR1Q99720 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SIGMAR1Q99720 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIGMAR1Q99720 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SIGMAR1Q99720 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIGMAR1Q99720 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIGMAR1Q99720 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIGMAR1Q99720 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIGMAR1Q99720 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SIGMAR1Q99720 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms