Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
UBL7Q96S82 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBL7Q96S82 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBL7Q96S82 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
UBL7Q96S82 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
UBL7Q96S82 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
UBL7Q96S82 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
UBL7Q96S82 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms