Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HHIPQ96QV1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HHIPQ96QV1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HHIPQ96QV1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HHIPQ96QV1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HHIPQ96QV1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HHIPQ96QV1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HHIPQ96QV1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms