Protein–RNA interactions for Protein: Q96PI1

SPRR4, Small proline-rich protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR4Q96PI1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPRR4Q96PI1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SPRR4Q96PI1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPRR4Q96PI1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SPRR4Q96PI1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPRR4Q96PI1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms