Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ROBO3Q96MS0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ROBO3Q96MS0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
ROBO3Q96MS0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ROBO3Q96MS0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ROBO3Q96MS0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
ROBO3Q96MS0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
ROBO3Q96MS0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
ROBO3Q96MS0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
ROBO3Q96MS0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
ROBO3Q96MS0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
ROBO3Q96MS0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
ROBO3Q96MS0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
ROBO3Q96MS0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms