Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SGCZQ96LD1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCZQ96LD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SGCZQ96LD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SGCZQ96LD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SGCZQ96LD1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SGCZQ96LD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SGCZQ96LD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SGCZQ96LD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SGCZQ96LD1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms