Protein–RNA interactions for Protein: Q96L12

CALR3, Calreticulin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALR3Q96L12 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CALR3Q96L12 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CALR3Q96L12 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CALR3Q96L12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALR3Q96L12 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALR3Q96L12 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALR3Q96L12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALR3Q96L12 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALR3Q96L12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALR3Q96L12 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CALR3Q96L12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALR3Q96L12 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CALR3Q96L12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CALR3Q96L12 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CALR3Q96L12 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms