Protein–RNA interactions for Protein: Q96KQ4

PPP1R13B, Apoptosis-stimulating of p53 protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R13BQ96KQ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R13BQ96KQ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PPP1R13BQ96KQ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R13BQ96KQ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R13BQ96KQ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PPP1R13BQ96KQ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PPP1R13BQ96KQ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PPP1R13BQ96KQ4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PPP1R13BQ96KQ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PPP1R13BQ96KQ4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPP1R13BQ96KQ4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPP1R13BQ96KQ4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPP1R13BQ96KQ4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPP1R13BQ96KQ4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms