Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PKNOX2Q96KN3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PKNOX2Q96KN3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PKNOX2Q96KN3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKNOX2Q96KN3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PKNOX2Q96KN3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKNOX2Q96KN3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PKNOX2Q96KN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PKNOX2Q96KN3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PKNOX2Q96KN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PKNOX2Q96KN3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PKNOX2Q96KN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PKNOX2Q96KN3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms