Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
HIC2Q96JB3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HIC2Q96JB3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
HIC2Q96JB3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HIC2Q96JB3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HIC2Q96JB3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HIC2Q96JB3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms