Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MED8Q96G25 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MED8Q96G25 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
MED8Q96G25 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MED8Q96G25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MED8Q96G25 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MED8Q96G25 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MED8Q96G25 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms