Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
ZNF428Q96B54 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
ZNF428Q96B54 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
ZNF428Q96B54 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
ZNF428Q96B54 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
ZNF428Q96B54 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ZNF428Q96B54 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF428Q96B54 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.07■■■■□ 3.05
ZNF428Q96B54 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF428Q96B54 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms