Protein–RNA interactions for Protein: Q96AT9

RPE, Ribulose-phosphate 3-epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEQ96AT9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPEQ96AT9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RPEQ96AT9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RPEQ96AT9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RPEQ96AT9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RPEQ96AT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
RPEQ96AT9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms