Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y0

NXPE3, NXPE family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPE3Q969Y0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NXPE3Q969Y0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NXPE3Q969Y0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NXPE3Q969Y0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NXPE3Q969Y0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NXPE3Q969Y0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NXPE3Q969Y0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NXPE3Q969Y0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms