Protein–RNA interactions for Protein: Q92928

RAB1C, Putative Ras-related protein Rab-1C, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1CQ92928 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB1CQ92928 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RAB1CQ92928 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB1CQ92928 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB1CQ92928 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB1CQ92928 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms