Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TTC9Q92623 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTC9Q92623 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTC9Q92623 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TTC9Q92623 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC9Q92623 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC9Q92623 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms