Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWP7

GIMAP1, GTPase IMAP family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMAP1Q8WWP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GIMAP1Q8WWP7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GIMAP1Q8WWP7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GIMAP1Q8WWP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GIMAP1Q8WWP7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GIMAP1Q8WWP7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMAP1Q8WWP7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms