Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
LMO7Q8WWI1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
LMO7Q8WWI1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LMO7Q8WWI1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
LMO7Q8WWI1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
LMO7Q8WWI1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
LMO7Q8WWI1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
LMO7Q8WWI1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LMO7Q8WWI1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LMO7Q8WWI1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
LMO7Q8WWI1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
LMO7Q8WWI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
LMO7Q8WWI1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
LMO7Q8WWI1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
LMO7Q8WWI1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
LMO7Q8WWI1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMO7Q8WWI1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
LMO7Q8WWI1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMO7Q8WWI1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
LMO7Q8WWI1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
LMO7Q8WWI1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
LMO7Q8WWI1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
LMO7Q8WWI1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms